Aktualności

Badanie roztworu Lizosomów metodą SAXS pozwoliło na obliczenie promienia bezwładności (Rg) i funkcję rozkładu odległości par (PDDF).

Wprowadzenie

Technika wąskokątowego rozpraszania promieniowania rentgenowskiego (SAXS) jest popularna przy badaniu systemów biologicznych a dokładniej roztworów białek. SAXS pozwala na ustalenie kształtu makromolekularnego poprzez rekonstrukcję kopertową. Zebrane dane pozwoliły na określenie promienia bezwładności Rg i funkcji rozkładu odległości par PDDF.

Pomiar i wyniki

Pomiaru dokonano na roztworze o stężeniu 1.5, 3.0 i 5.0 mg/ml w systemie Xenocs Capillary Flow Cell, wykorzystując jako bufor 40 mM kwas octowy i 50 mM NaCl pH 4.0.

Wyniki parametru strukturalnego Rg zostały uzyskane poprzez obliczenia przy wykorzystaniu oprogramowania PRIMUS¹. Dane są porównywalne z tymi uzyskanymi z synchrotronu² – Rg = 1.43 nm. Krótki czas ekspozycji (10min) jest wystarczający do określenia tego parametru.

PDDF p(r) został obliczony przy pomocy oprogramowania GNOM¹. Na rysunku 1 zaobserwować można,
że krzywe uzyskane z różnych stężeń nakładają się. Dowodzi to, że wiarygodne dane mogą być uzyskane nawet przy pomiarach niskiego stężenia.

Porównanie dwóch czasów ekspozycji dla stężenia 5 mg/ml przedstawione jest na rysunku 2. Krzywe praktycznie nakładają się, co dowodzi, że 10 minutowy czas ekspozycji jest wystarczający do uzyskania wiarygodnych wyników.

Co dalej ?

Technologia Xenocs clean-beam technology³ jest w pełni zintegrowana z Nano-inXider co pozwala na badania bio-makromolekularne mocno rozcieńczonych roztworów.

Ponadto, niskoszumowe komory przepływowe Xenocs pozwalają na obniżenie limitów pomiarowych BioSAXS.

1Petoukhov et al., J. Appl. Cryst., 2007,40, s223-s2282

2Svergun et al, J. Appl. Cryst., 2005, 38, 555–558

3TN-XE03 – Unique Signal-to-Noise ratio